1.3 几何、单位与倒空间
这些输入和起始模型为未执行的教学示例。原创配图为示意图,不是计算结果。使用前请验证版本相关语法、授权数据、数值收敛及科学模型。
1.3.1 模型、单位与来源记录
PW 截断能与能量使用 Ry,常见力输出使用 Ry/bohr,压力使用 kbar。几何卡片须明确坐标单位。不同程序具有不同输入语法与时间单位约定。
1.3.2 未执行输入与明确修改片段
按照下方说明确认每个片段的母计算与替换位置;片段不自动构成独立输入。保留空行与文件来源要求。
1.3.2.1 输入块 1
! Form A: insert into SYSTEM
ibrav = 2, A = 5.43, nat = 2, ntyp = 1
! Corresponding atomic card
ATOMIC_POSITIONS crystal
Si 0.00 0.00 0.00
Si 0.25 0.25 0.25
1.3.2.2 输入块 2
! Form B: SYSTEM uses ibrav=0, nat=2, ntyp=1; omit A/celldm
CELL_PARAMETERS angstrom
-2.715 0.000 2.715
0.000 2.715 2.715
-2.715 2.715 0.000
ATOMIC_POSITIONS crystal
Si 0.00 0.00 0.00
Si 0.25 0.25 0.25
1.3.3 实作研究
1.3.3.1 原理与准备
输入语法合法,也可能代表错误的晶体。本例以两种形式建立相同金刚石型硅原胞,理解分数坐标如何依赖晶格矢量。需要基本向量知识和结构查看器。下方 5.43 Å 只是教学起始结构,并非本课程预测的平衡结果。
1.3.3.2 原创双表示
参见上方输入块 1。
计算三晶格矢量组成矩阵的行列式绝对值,此面心立方原胞应为 a³/4。将第二原子的分数坐标按晶格矢量线性组合转为笛卡尔坐标,再考虑周期镜像检查最近邻。某个矢量含负号并不意味着错误。两种表示的 SCF 必须使用相同物理 k 点采样和赝势。
1.3.3.3 检查与解释
比较输出体积、最近邻距离、识别到的对称性与总能。由实空间晶格推导倒格矢,检查 aᵢ·bⱼ=2πδᵢⱼ。旋转或重排晶胞后,仅沿用高对称点名称不够,数值坐标也必须匹配新倒空间基底。单独 Γ 点与带偏移的单点网格未必是同一个采样点。
练习:在副本中故意把 angstrom 改为 bohr,先不要提交昂贵计算。预测长度与体积会如何出错,再用结构检查验证。继续学习前恢复正确单位,将它记录为“语法成功、物理失败”的案例。