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环境、GPW 与输入树

本页输入是教学模板,本课程未实际执行这些计算。请使用授权安装,核对版本相关选项,并建立自己的收敛证据。

一条一致的安装路线

集群优先用中心验证模块,个人可用独立 Conda 或发行包,官方还列容器、Spack、Homebrew。包内 MPI 不和不匹配启动器混用,记录版本,不悄升级。官方安装。

conda search -c conda-forge cp2k
# Replace VERSION with an available build for your platform.
conda create -n cp2k-course -c conda-forge cp2k=VERSION
conda activate cp2k-course
cp2k -h
cp2k --version

VERSION 须替换。若提供 cp2k.psmp,所有命令一起换;psmp 常为 MPI+OpenMP,名称依包。首个单进程 OMP_NUM_THREADS=1,集群启动按本站。ARCHER2。

mkdir -p cp2k-course/01-water
cd cp2k-course/01-water
export OMP_NUM_THREADS=1
command -v cp2k
cp2k --version > executable-version.txt
# Locate and copy these files from your verified installation first.
ls -l BASIS_MOLOPT GTH_POTENTIALS
sha256sum BASIS_MOLOPT GTH_POTENTIALS > data-files.sha256

按安装文档找 BASIS_MOLOPT 与 GTH_POTENTIALS,复制核实文件或填明确绝对路径。首例假设本地副本;不随机下载同名或混未记录发行版。哈希标识内容,开源软件与数据再分发仍遵守相应许可。

GPW 的两个表示

原子高斯基描述轨道,辅助实空间/平面波处理密度和静电,所以基组与网格截断不同,不能互补错误。Quickstep 论文。PBE、GTH-PBE、兼容 MOLOPT 构成模型;H q1/O q6 给水八个显式价电子,不能以匹配十电子全电子绝对能作验证。

层级属于语法

GLOBAL
FORCE_EVAL
  DFT
    QS
    MGRID
    POISSON
    SCF
      OT
    XC
  SUBSYS
    CELL
    COORD
    KIND O
    KIND H
MOTION                 (only when needed)
  GEO_OPT or MD
  PRINT

GLOBAL 选任务,FORCE_EVAL 下 DFT 和 SUBSYS;MOTION 是同级,SCF 在 DFT,GEO_OPT 在 MOTION。缩进供人看,&SECTION 和匹配 END 才定结构。关键词通常不区大小写,Linux 路径区分。EPCC 实践。坐标 Å、截断 Ry、能量通常 hartree、力通常 hartree/bohr,看表头。多数引用固定 2025.2,实际匹配已装版。

练习

画树、定位数据与哈希,解释八电子模型与 CUTOFF 不能修小轨道基组,不需执行计算。


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