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5.4 吸附能首先是参考账本问题

这些输入和起始模型为未执行的教学示例。原创配图为示意图,不是计算结果。使用前请验证版本相关语法、授权数据、数值收敛及科学模型。

5.4.1 模型、单位与来源记录

保持基组、赝势文件与程序版本可追溯。网格控制使用 Ry;常见能量与力输出使用 hartree 和 hartree/bohr。以各输出标题所示单位为准。

共享输入、约定与证据

原创示意图:吸附能首先是参考账本问题。不声称已有数值计算结果。
原创示意图:吸附能首先是参考账本问题。不声称已有数值计算结果。

5.4.2 实作研究

直觉。 吸附能必须先明确表面、吸附物状态、覆盖度及参考反应。表面松弛、分子形变和横向吸附物相互作用都会改变结果。采用案例 17 已验证的绝缘薄层与中性分子,实际坐标和方向由学习者提供。本例是设计方案,不捏造吸附预测。

输入及流程。 建立三套一致模型:薄层加分子、相同超胞与约束约定的清洁薄层、独立收敛非周期盒中的孤立分子。基组、泛函、色散与数值精度一致;若研究冻结片段作用,则分离计算保留吸附后的几何,并考虑幽灵函数。主要修改是删除正确坐标/KIND、核对电荷自旋、孤立参考采用合适边界及不同项目名,没有一个关键词能自动保证参考科学一致。写清 S+M→S–M 与 Eads=ES–M−ES−EM,负值表示该约定下电子稳定化。测试多个位置和取向,按声明的固定底层优化,再在最终精度重算参考,分离形变项,并独立检查横向面积、厚度和真空。

解读与检验。 不同面积对应不同覆盖度,除以分子数不能消除横向作用。发生解离时必须说明所有原子的去向并平衡参考反应。某位点优化能低不证明动力学可达,零温表面排序也不是催化周转预测。组合体系与清洁表面的固定层应一致,构建工具若改变原子顺序可能使固定列表失效。电荷转移时要分析有限尺寸和静电参考。孤立分子与表面可用不同但各自正确的边界,却不能混用 PBE 与 PBE-D3 来定义同一吸附能。

练习与图示。 为分子吸附及解离吸附写出原子、电荷平衡的完整能量账本,指出所需气相或库参考。用收敛测试估计位点排序不确定性,而非堆小数位。

5.4.3 相关计算

5.4.4 来源与进一步阅读